Этот вопрос нужно рассматривать индивидуально.
Какие задачи вам нужно выполнять?
Возможно у вас появятся сложности с запуском определённых программ, так как они могут работать только в Windows, на Linux их запустить не получится, потребуется искать аналог.
Так же у Вам может возникнуть сложность с работой некоторых устройств, которые невозможно использовать на Linux, например некоторые модели сканеров, несовместимые принтеры, плоттер, веб-камера и другие устройства, драйверов на которые не найти для ОС LINUX. Этот вопрос должен прорабатываться индивидуально.